הדור השני של מאזדה 3 (קוד BL) הגיע ב-2009 עם עיצוב חיצוני מחודש ושיפורים משמעותיים בציוד הבטיחות. הרכב קיבל מערכות בטיחות מתקדמות יותר ועיצוב פנים מוקפד יותר, תוך שמירה על הפלטפורמה שנוסתה בדור הראשון.
בישראל נמכר הדור השני עם מנוע MZR 2.0 בנזין משופר, בגרסאות סדאן ו-Hatchback. הרכב נמכר בהצלחה ניכרת ומאזדה חיזקה את מעמדה כמותג נהיגה איכותי. קרסו מוטורס סיפקה ציוד עשיר יחסית לפלח המחיר.